Diplômée de l'IEP de Grenoble et titulaire d'un Master sur le Développement, la Coopération et l'action Humanitaire (Université Panthéon-Sorbonne), Fabienne Lassalle a coordonné pendant 12 ans des projets de développement financés par les bailleurs de fonds internationaux (Commission européenne, Banque Mondiale, Banques régionales de développement) en Afrique, Europe de l'Est, Asie et Amérique Latine. Elle a également été pendant 8 ans, Directrice associée de Gondwana Biodiversity Development, société de conseil pour la protection de la Biodiversité.
En juin 2015, elle rejoint à sa création l’association SOS MÉDITERRANÉE France qui a pour objectif de mener des opérations de sauvetage en Méditerranée centrale, route migratoire maritime la plus mortelle au monde. Fabienne Lassalle occupe aujourd'hui le poste de Directrice adjointe. SOS MÉDITERRANÉE France fait partie du réseau européen SOS MÉDITERRANÉE qui comprend trois autres associations en Allemagne, en Italie et en Suisse.